Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FynP39688 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FynP39688 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FynP39688 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FynP39688 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FynP39688 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms