Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik2P39087 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms