Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lig1P37913 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms