Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc5P35689 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc5P35689 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms