Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpoP35419 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpoP35419 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpoP35419 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpoP35419 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpoP35419 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpoP35419 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpoP35419 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpoP35419 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpoP35419 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpoP35419 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TpoP35419 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms