Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp12P34960 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms