Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms