Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtgfP29268 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms