Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcdP28867 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms