Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CftrP26361 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CftrP26361 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CftrP26361 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CftrP26361 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CftrP26361 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CftrP26361 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CftrP26361 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CftrP26361 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CftrP26361 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CftrP26361 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CftrP26361 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CftrP26361 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CftrP26361 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CftrP26361 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CftrP26361 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CftrP26361 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CftrP26361 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CftrP26361 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CftrP26361 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CftrP26361 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CftrP26361 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CftrP26361 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CftrP26361 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CftrP26361 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CftrP26361 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CftrP26361 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CftrP26361 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CftrP26361 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CftrP26361 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CftrP26361 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CftrP26361 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms