Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk11bP24788 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 547.3 ms