Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd12P23812 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms