Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RarbP22605 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RarbP22605 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RarbP22605 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RarbP22605 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RarbP22605 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RarbP22605 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RarbP22605 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RarbP22605 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RarbP22605 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RarbP22605 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RarbP22605 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms