Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk1P22518 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms