Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp4P21275 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms