Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TP20293 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TP20293 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TP20293 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TP20293 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TP20293 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TP20293 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms