Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc1P19123 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms