Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms