Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim30aP15533 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim30aP15533 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms