Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SptbP15508 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SptbP15508 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SptbP15508 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SptbP15508 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SptbP15508 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SptbP15508 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SptbP15508 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SptbP15508 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SptbP15508 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SptbP15508 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SptbP15508 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SptbP15508 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SptbP15508 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms