Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scd1P13516 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scd1P13516 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms