Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnmt3cP0DOY1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms