Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr1P08046 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms