Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04212 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04212 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04212 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04212 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P04212 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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