Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01641 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01641 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01641 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
P01641 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01641 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
P01641 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01641 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01641 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01641 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms