Protein–RNA interactions for Protein: P01634

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01634 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01634 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01634 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01634 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01634 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01634 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01634 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01634 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01634 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01634 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms