Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01629 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01629 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01629 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01629 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01629 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01629 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms