Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcn2O88968 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms