Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MscO88940 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MscO88940 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MscO88940 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MscO88940 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MscO88940 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MscO88940 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MscO88940 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MscO88940 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MscO88940 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MscO88940 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MscO88940 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MscO88940 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MscO88940 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MscO88940 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MscO88940 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms