Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms