Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AurkcO88445 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AurkcO88445 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms