Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl22O88430 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl22O88430 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms