Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tulp3O88413 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms