Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt1O88346 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms