Protein–RNA interactions for Protein: O88245

Gm10139, Mszf85 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm10139O88245 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm10139O88245 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm10139O88245 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm10139O88245 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm10139O88245 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm10139O88245 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm10139O88245 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm10139O88245 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm10139O88245 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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