Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CaskO70589 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CaskO70589 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CaskO70589 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CaskO70589 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CaskO70589 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CaskO70589 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CaskO70589 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CaskO70589 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CaskO70589 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CaskO70589 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CaskO70589 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CaskO70589 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CaskO70589 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CaskO70589 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CaskO70589 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms