Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
OtogO55225 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
OtogO55225 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
OtogO55225 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
OtogO55225 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
OtogO55225 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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