Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Eif6O55135 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Eif6O55135 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms