Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zmat3O54836 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zmat3O54836 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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