Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gp1baO35930 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms