Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r2O35926 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms