Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atf6bO35451 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf6bO35451 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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