Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn1O35350 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn1O35350 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn1O35350 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn1O35350 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn1O35350 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn1O35350 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn1O35350 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms