Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d1bO35324 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms