Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bhlhe40O35185 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms