Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Nedd9O35177 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nedd9O35177 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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