Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capn5O08688 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn5O08688 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn5O08688 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn5O08688 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn5O08688 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn5O08688 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn5O08688 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms