Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Barx2O08686 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Barx2O08686 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Barx2O08686 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms