Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn2r88L7N1W8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms