Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm2888K7N746 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm2888K7N746 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm2888K7N746 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm2888K7N746 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2888K7N746 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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